Всю свою историю Ордос был ареной противоборства между китайцами и степняками.

С началом маньчжурского завоевания Китая Ордос был разделён в 1649 году на 6 хошунов (Ордосские левое и правое «крылья», каждое из которых в свою очередь делилось на переднее, среднее и тыльное «знамя»); точные границы между ними были зафиксированы в 1740 году. Было установлено, что китайцы не должны селиться на территориях монголов, а монголы могут ездить в Китай лишь по разрешениям. Тем не менее с начала XVIII века имела место китайская миграция. В связи с цинским курсом «новой политики» в начале XX века для администрирования оседлых жителей был создан Дуншэнский комиссариат. После восстания ихэтуаней китайцам разрешили колонизировать земли монголов во Внутренней Монголии и Маньчжурии.